MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 68115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017310	ACC	2	6	339	344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151874
2	NC_017310	CGC	2	6	359	364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151874
3	NC_017310	AAG	2	6	384	389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151874
4	NC_017310	CTT	2	6	393	398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151874
5	NC_017310	CTT	2	6	479	484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151874
6	NC_017310	CTG	2	6	540	545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151874
7	NC_017310	TTG	2	6	562	567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387151874
8	NC_017310	GCCC	2	8	667	674	0 %	0 %	25 %	75 %	387151874
9	NC_017310	TCA	2	6	685	690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151874
10	NC_017310	TGCGC	2	10	705	714	0 %	20 %	40 %	40 %	387151874
11	NC_017310	TTC	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151874
12	NC_017310	GCT	2	6	770	775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151874
13	NC_017310	GCT	2	6	821	826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151874
14	NC_017310	CGT	2	6	830	835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151874
15	NC_017310	ACG	2	6	847	852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151874
16	NC_017310	CAA	2	6	857	862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387151874
17	NC_017310	GAA	2	6	878	883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151874
18	NC_017310	ACC	2	6	907	912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151874
19	NC_017310	ATC	2	6	975	980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151874
20	NC_017310	ATCAA	2	10	990	999	60 %	20 %	0 %	20 %	387151874
21	NC_017310	ACCGCA	2	12	1090	1101	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387151875
22	NC_017310	GCG	2	6	1107	1112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151875
23	NC_017310	CTT	2	6	1144	1149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151875
24	NC_017310	TCC	2	6	1247	1252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387151875
25	NC_017310	GCA	2	6	1256	1261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151875
26	NC_017310	AAC	2	6	1469	1474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387151875
27	NC_017310	TC	4	8	1490	1497	0 %	50 %	0 %	50 %	387151875
28	NC_017310	TGC	2	6	1770	1775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151876
29	NC_017310	CAA	2	6	1814	1819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387151876
30	NC_017310	ATC	2	6	1826	1831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151876
31	NC_017310	CAG	2	6	1855	1860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151876
32	NC_017310	GAA	2	6	1970	1975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151876
33	NC_017310	TCAGTC	2	12	2007	2018	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387151876
34	NC_017310	GCTC	2	8	2026	2033	0 %	25 %	25 %	50 %	387151876
35	NC_017310	CTG	2	6	2055	2060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151876
36	NC_017310	GAT	2	6	2105	2110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151876
37	NC_017310	CTG	2	6	2150	2155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151876
38	NC_017310	GACC	2	8	2161	2168	25 %	0 %	25 %	50 %	387151876
39	NC_017310	ATC	2	6	2198	2203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151876
40	NC_017310	CTAC	2	8	2241	2248	25 %	25 %	0 %	50 %	387151876
41	NC_017310	GGAA	2	8	2250	2257	50 %	0 %	50 %	0 %	387151876
42	NC_017310	CAA	2	6	2314	2319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387151876
43	NC_017310	ACT	2	6	2350	2355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151876
44	NC_017310	ACAGA	2	10	2405	2414	60 %	0 %	20 %	20 %	387151876
45	NC_017310	GAC	2	6	2447	2452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151876
46	NC_017310	CGCC	2	8	2467	2474	0 %	0 %	25 %	75 %	387151876
47	NC_017310	GCA	2	6	2500	2505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151877
48	NC_017310	TCG	2	6	2578	2583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151877
49	NC_017310	CGA	2	6	2597	2602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151877
50	NC_017310	TC	3	6	2629	2634	0 %	50 %	0 %	50 %	387151877
51	NC_017310	GTG	2	6	2652	2657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151877
52	NC_017310	GC	3	6	2703	2708	0 %	0 %	50 %	50 %	387151877
53	NC_017310	GCG	2	6	2769	2774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151877
54	NC_017310	CGCC	2	8	2864	2871	0 %	0 %	25 %	75 %	387151877
55	NC_017310	TGC	2	6	2881	2886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151877
56	NC_017310	CGG	2	6	2915	2920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151877
57	NC_017310	CG	3	6	2971	2976	0 %	0 %	50 %	50 %	387151877
58	NC_017310	TCC	2	6	3054	3059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387151877
59	NC_017310	TCG	2	6	3076	3081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151877
60	NC_017310	CAG	2	6	3169	3174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151877
61	NC_017310	GCT	2	6	3195	3200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151877
62	NC_017310	ACG	2	6	3243	3248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151877
63	NC_017310	ACG	2	6	3325	3330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151877
64	NC_017310	GGC	2	6	3452	3457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151877
65	NC_017310	CGA	2	6	3470	3475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151877
66	NC_017310	AAG	2	6	3658	3663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151878
67	NC_017310	GAT	2	6	3714	3719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151878
68	NC_017310	CAGGA	2	10	3792	3801	40 %	0 %	40 %	20 %	387151878
69	NC_017310	AAG	2	6	3802	3807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151878
70	NC_017310	GAT	3	9	3933	3941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151878
71	NC_017310	TAT	2	6	3945	3950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387151878
72	NC_017310	AGA	2	6	4115	4120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151879
73	NC_017310	CG	3	6	4124	4129	0 %	0 %	50 %	50 %	387151879
74	NC_017310	CAA	2	6	4307	4312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387151879
75	NC_017310	ACC	2	6	4416	4421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151879
76	NC_017310	GCCCA	2	10	4425	4434	20 %	0 %	20 %	60 %	387151879
77	NC_017310	GCC	2	6	4509	4514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151879
78	NC_017310	CCCGG	2	10	4527	4536	0 %	0 %	40 %	60 %	387151879
79	NC_017310	GGC	2	6	4545	4550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151879
80	NC_017310	GGCG	2	8	4561	4568	0 %	0 %	75 %	25 %	387151879
81	NC_017310	CAG	2	6	4571	4576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151879
82	NC_017310	GCAC	2	8	4579	4586	25 %	0 %	25 %	50 %	387151879
83	NC_017310	GCA	2	6	4663	4668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151879
84	NC_017310	CAG	2	6	4723	4728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151879
85	NC_017310	CAC	2	6	4787	4792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151879
86	NC_017310	GCCC	2	8	4804	4811	0 %	0 %	25 %	75 %	387151879
87	NC_017310	CAG	2	6	4877	4882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151879
88	NC_017310	GTT	2	6	4916	4921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387151879
89	NC_017310	GCA	2	6	4979	4984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151879
90	NC_017310	CAG	2	6	4995	5000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151879
91	NC_017310	GTC	2	6	5005	5010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151879
92	NC_017310	CAC	2	6	5032	5037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151879
93	NC_017310	AC	3	6	5071	5076	50 %	0 %	0 %	50 %	387151879
94	NC_017310	AC	3	6	5098	5103	50 %	0 %	0 %	50 %	387151879
95	NC_017310	GCA	2	6	5153	5158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151879
96	NC_017310	GGC	2	6	5268	5273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151879
97	NC_017310	G	6	6	5298	5303	0 %	0 %	100 %	0 %	387151879
98	NC_017310	AG	3	6	5413	5418	50 %	0 %	50 %	0 %	387151879
99	NC_017310	AG	3	6	5428	5433	50 %	0 %	50 %	0 %	387151879
100	NC_017310	GGC	2	6	5442	5447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151879
101	NC_017310	GC	3	6	5464	5469	0 %	0 %	50 %	50 %	387151879
102	NC_017310	ACG	2	6	5470	5475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151879
103	NC_017310	CGA	2	6	5486	5491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151879
104	NC_017310	G	6	6	5509	5514	0 %	0 %	100 %	0 %	387151879
105	NC_017310	GAA	2	6	5869	5874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151880
106	NC_017310	CGC	2	6	5916	5921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151880
107	NC_017310	C	7	7	5957	5963	0 %	0 %	0 %	100 %	387151880
108	NC_017310	GAT	2	6	6135	6140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151880
109	NC_017310	CAC	2	6	6159	6164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151880
110	NC_017310	GCG	2	6	6168	6173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151880
111	NC_017310	CG	3	6	6172	6177	0 %	0 %	50 %	50 %	387151880
112	NC_017310	ACC	2	6	6183	6188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151880
113	NC_017310	GA	3	6	6201	6206	50 %	0 %	50 %	0 %	387151880
114	NC_017310	GCAG	2	8	6314	6321	25 %	0 %	50 %	25 %	387151880
115	NC_017310	TCA	2	6	6343	6348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151880
116	NC_017310	ACCG	2	8	6356	6363	25 %	0 %	25 %	50 %	387151880
117	NC_017310	TTG	2	6	6385	6390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387151880
118	NC_017310	TGA	2	6	6395	6400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151880
119	NC_017310	AAG	2	6	6444	6449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151880
120	NC_017310	AGC	2	6	6655	6660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151880
121	NC_017310	TGA	2	6	6689	6694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151880
122	NC_017310	CA	3	6	6765	6770	50 %	0 %	0 %	50 %	387151880
123	NC_017310	CGCCT	2	10	6957	6966	0 %	20 %	20 %	60 %	387151881
124	NC_017310	CTT	2	6	6975	6980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151881
125	NC_017310	AGGT	2	8	7006	7013	25 %	25 %	50 %	0 %	387151881
126	NC_017310	AGGCGA	2	12	7025	7036	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	387151881
127	NC_017310	CGA	2	6	7055	7060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151881
128	NC_017310	GCT	2	6	7079	7084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151881
129	NC_017310	AGC	2	6	7087	7092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151881
130	NC_017310	CACGC	2	10	7179	7188	20 %	0 %	20 %	60 %	387151881
131	NC_017310	GGC	2	6	7254	7259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151881
132	NC_017310	CGT	2	6	7274	7279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151881
133	NC_017310	ATG	2	6	7294	7299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151881
134	NC_017310	GC	3	6	7314	7319	0 %	0 %	50 %	50 %	387151881
135	NC_017310	CCCA	2	8	7341	7348	25 %	0 %	0 %	75 %	387151881
136	NC_017310	TCG	2	6	7384	7389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151881
137	NC_017310	GCA	3	9	7412	7420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151881
138	NC_017310	GTT	2	6	7436	7441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387151881
139	NC_017310	ACC	2	6	7444	7449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151881
140	NC_017310	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151881
141	NC_017310	GCG	2	6	7507	7512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151881
142	NC_017310	GCA	2	6	7526	7531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151881
143	NC_017310	GGC	2	6	7602	7607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151881
144	NC_017310	CGG	2	6	7718	7723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151881
145	NC_017310	CTG	2	6	7734	7739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151881
146	NC_017310	CGA	2	6	7778	7783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151881
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148	NC_017310	CGC	2	6	7821	7826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151881
149	NC_017310	GCG	2	6	7862	7867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151881
150	NC_017310	TTC	2	6	7881	7886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151882
151	NC_017310	GGC	2	6	7915	7920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151882
152	NC_017310	GGT	2	6	7951	7956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151882
153	NC_017310	GCAG	2	8	7969	7976	25 %	0 %	50 %	25 %	387151882
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155	NC_017310	GC	3	6	8067	8072	0 %	0 %	50 %	50 %	387151882
156	NC_017310	TGA	2	6	8143	8148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151882
157	NC_017310	GGC	2	6	8200	8205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151882
158	NC_017310	CACC	2	8	8212	8219	25 %	0 %	0 %	75 %	387151882
159	NC_017310	TGCGG	2	10	8220	8229	0 %	20 %	60 %	20 %	387151882
160	NC_017310	TCG	2	6	8292	8297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151882
161	NC_017310	TCG	2	6	8304	8309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151882
162	NC_017310	GTC	2	6	8312	8317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151882
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165	NC_017310	GAG	2	6	8827	8832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387151883
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168	NC_017310	CGG	2	6	8973	8978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151883
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209	NC_017310	C	6	6	10922	10927	0 %	0 %	0 %	100 %	387151884
210	NC_017310	ACC	2	6	10961	10966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151884
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248	NC_017310	CCT	2	6	13616	13621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387151886
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250	NC_017310	CAC	2	6	13674	13679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151886
251	NC_017310	CCG	2	6	13688	13693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151886
252	NC_017310	TCG	2	6	13711	13716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151886
253	NC_017310	GCAAGC	2	12	13723	13734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151886
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256	NC_017310	GTGA	2	8	13831	13838	25 %	25 %	50 %	0 %	387151886
257	NC_017310	GGC	2	6	13903	13908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151886
258	NC_017310	GCA	2	6	13967	13972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151886
259	NC_017310	GCC	2	6	13974	13979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151886
260	NC_017310	CCT	2	6	14042	14047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387151886
261	NC_017310	CAT	2	6	14058	14063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151886
262	NC_017310	GGC	2	6	14082	14087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151886
263	NC_017310	GCG	2	6	14134	14139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151886
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265	NC_017310	GCC	2	6	14203	14208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151886
266	NC_017310	CCG	2	6	14288	14293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151886
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269	NC_017310	ACC	2	6	14611	14616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151886
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293	NC_017310	GCA	2	6	16138	16143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151887
294	NC_017310	GCG	2	6	16144	16149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151887
295	NC_017310	GGC	2	6	16178	16183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151887
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299	NC_017310	GATGCG	2	12	16244	16255	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387151887
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302	NC_017310	GCC	2	6	16334	16339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151887
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385	NC_017310	GAA	2	6	19839	19844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151890
386	NC_017310	ACG	2	6	19891	19896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151890
387	NC_017310	GCA	2	6	19910	19915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151890
388	NC_017310	ATCG	2	8	19917	19924	25 %	25 %	25 %	25 %	387151890
389	NC_017310	ATC	2	6	19933	19938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151890
390	NC_017310	TGT	2	6	19958	19963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387151890
391	NC_017310	CG	3	6	19991	19996	0 %	0 %	50 %	50 %	387151890
392	NC_017310	CGA	2	6	20032	20037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151890
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395	NC_017310	CGTAT	2	10	20250	20259	20 %	40 %	20 %	20 %	387151890
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400	NC_017310	TGA	2	6	20387	20392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151890
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497	NC_017310	C	6	6	25643	25648	0 %	0 %	0 %	100 %	387151895
498	NC_017310	ATG	2	6	25703	25708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151895
499	NC_017310	CACG	2	8	25737	25744	25 %	0 %	25 %	50 %	387151895
500	NC_017310	AGC	2	6	25766	25771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151895

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